Поначалу Марион исполняла небольшие роли в театре и на телевидении в сериалах. Впервые в кино она появилась в 1995 году в романтической картине «История мальчика, который хотел, чтобы его поцеловали». В 1996 году актриса сыграла студентку в ленте «Как я обсуждал… (мою половую жизнь)» и Машу в комедии «Зеленая красавица». Марион довольно много работала, но желанный успех не приходил. В 1997 году Котийяр сыграла роль в спектакле «Прекращенное дело», за которую ей была вручена первая престижная награда.
В этот же период она получила главную роль в захватывающей французской комедии «Такси» Люка Бессона. Фильм полюбился зрителям не только во Франции, но и далеко за ее пределами. Марион стала узнаваемой и была номинирована за роль Лили на премию «Сезар» как перспективная молодая актриса. Через два года Котийяр появилась в продолжении фильма: с ее участием вышли «Такси 2» и в 2003 году — «Такси 3». В 1999 году Марион появляется в научно-фантастической картине «Фурия» и драматическом военном фильме «Война в горах». В 2001 году выходит два фильма, роли в которых укрепили за актрисой статус будущей звезды. В мелодраме «Милые штучки» Марион сыграла сразу двух персонажей, причем совершенно противоположных по характеру, — сестер Люси и Мари. Талантливая актриса снова была номинирована на «Сезар». Второй заметный фильм 2001 года — драма «Лиза», за роль в котором Котийяр получила награду «Верона» как лучшая актриса.
В 2003 году она снялась в сложной роли дочери польского иммигранта Софи в картине «Влюбись в меня, если осмелишься». В этом же году актриса появляется в первом для нее крупном иностранном проекте —фильме «Крупная рыба» с Дэнни Де Вито и другими знаменитыми актерами. В 2004 году Котийяр сыграла Тину Ломбарди в драматической картине «Долгая помолвка» и на этот раз выиграла «Сезар» в номинации «Лучшая исполнительница женской роли второго плана». Образ бывшей проститутки, разыскивающей своего любимого, потребовал от актрисы сильнейшего нервного напряжения и настоящего мастерства, чтобы заставить зрителя прочувствовать пиковые чувства человека — любовь и месть. В 2005 году актриса появилась в романтической драме «Кавалькада» в роли Ализи и в этом же году в религиозной картине «Мария». Марион появилась на экранах в фильме «Черный ящик» в роли Изабеллы Крюгер и Элис в картине «Жизнь в воздухе». В 2006 году актриса играет Фанни Шеналь в романтическом комедийном фильме «Хороший год» с Расселом Кроу.
Все роли этих лет по-разному воспринимаются зрителями и критиками, Марион уже имеет международную известность и успех, но ее главный триумф, ее главная роль еще впереди. 2007 год. Из бесчисленного множества актрис, пришедших на кастинг самого ожидаемого во Франции фильма «Жизнь в розовом цвете», режиссер Оливье Даан выбрал Марион. Даан увидел глаза актрисы и сразу заметил поразительное сходство между легендарной Эдит Пиаф и современной молодой актрисой Марион Котийяр. Она сразу же была утверждена на эту сложную роль, и режиссер не ошибся. Картина имела колоссальный успех, критики восклицали, что это сама Эдит Пиаф перевоплотилась в Марион, чтобы в последний раз спеть на сцене. В феврале 2008 года Котийяр была награждена премиями «Золотой глобус» и «Сезар» за лучшую женскую роль и в этой же номинации. Марион стала второй актрисой (после Софи Лорен) за всю историю вручения «Оскар», которая смогла завоевать эту престижную награду за роль в картине на иностранном языке. На следующий день после торжественной церемонии вручения «Оскар» Марион получила поздравления от главы французского государства Николя Саркози.
В 2009 году Котийяр появилась в картине «Public Enemies» с Джонни Деппом. И в этом же году актриса предстала в музыкальном комедийном фильме «Девять», где можно увидеть таких как Софи Лорен, Николь Кидман, Пенелопа Крус, Кейт Хадсон. За исполнение роли Луизы в этом фильме Марион была номинирована на «Золотой глобус» как лучшая исполнительница женской роли. В 2010 году Котийяр была награждена за вклад в развитие культуры этой страны. В 2010 году Марион . В июле 2010 года вышла , где Марион работала с Леонардо Ди Каприо. Среди фильмов 2011 года актриса появится в ведущей роли в ленте «Инфекция» наряду с Джудом Лоу, Гвинет Пэлтроу и Кейт Уинслет.
И в этом же году . Весной 2011 года стало известно, что Марион будет сниматься , показ которого запланирован на 2012 год.
